Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms