Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms