Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms