Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYLC1P35663 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYLC1P35663 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLC1P35663 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLC1P35663 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLC1P35663 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms