Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD12P35452 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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HOXD12P35452 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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HOXD12P35452 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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HOXD12P35452 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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HOXD12P35452 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD12P35452 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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