Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRS3P32247 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms