Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA10P31260 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA10P31260 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms