Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA5P30532 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms