Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK3P27448 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK3P27448 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK3P27448 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK3P27448 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK3P27448 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms