Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms