Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSSP25774 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSSP25774 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTSSP25774 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTSSP25774 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTSSP25774 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms