Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD247P20963 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD247P20963 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD247P20963 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD247P20963 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD247P20963 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms