Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCC1P18754 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCC1P18754 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCC1P18754 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCC1P18754 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RCC1P18754 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RCC1P18754 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RCC1P18754 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RCC1P18754 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCC1P18754 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCC1P18754 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RCC1P18754 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCC1P18754 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCC1P18754 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCC1P18754 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms