Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCLP18206 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCLP18206 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCLP18206 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCLP18206 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCLP18206 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCLP18206 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VCLP18206 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCLP18206 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCLP18206 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VCLP18206 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VCLP18206 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VCLP18206 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VCLP18206 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VCLP18206 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VCLP18206 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VCLP18206 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VCLP18206 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms