Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms