Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD44P16070 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD44P16070 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CD44P16070 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD44P16070 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD44P16070 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms