Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCG2P13521 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG2P13521 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG2P13521 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms