Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL5P13501 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL5P13501 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL5P13501 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL5P13501 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL5P13501 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL5P13501 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL5P13501 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms