Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FCER1AP12319 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms