Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD8BP10966 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD8BP10966 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD8BP10966 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD8BP10966 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms