Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGAP10645 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGAP10645 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGAP10645 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHGAP10645 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHGAP10645 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGAP10645 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGAP10645 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGAP10645 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGAP10645 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGAP10645 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGAP10645 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGAP10645 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGAP10645 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms