Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI3P10071 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI3P10071 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GLI3P10071 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GLI3P10071 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GLI3P10071 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GLI3P10071 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI3P10071 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms