Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD1P0DJD0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms