Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4AP0C0L4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C4AP0C0L4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms