Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXC6P09630 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC6P09630 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms