Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP3P08254 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP3P08254 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP3P08254 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP3P08254 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP3P08254 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms