Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDN1P05305 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDN1P05305 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDN1P05305 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDN1P05305 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDN1P05305 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDN1P05305 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDN1P05305 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDN1P05305 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDN1P05305 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDN1P05305 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDN1P05305 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDN1P05305 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDN1P05305 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDN1P05305 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDN1P05305 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms