Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3P05106 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGB3P05106 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB3P05106 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB3P05106 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB3P05106 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms