Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV12-3P01733 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms