Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHBP01229 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHBP01229 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHBP01229 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHBP01229 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHBP01229 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHBP01229 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHBP01229 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHBP01229 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHBP01229 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHBP01229 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHBP01229 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHBP01229 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHBP01229 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHBP01229 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHBP01229 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHBP01229 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms