Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD4O95243 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD4O95243 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD4O95243 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD4O95243 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD4O95243 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms