Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC45O75419 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC45O75419 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC45O75419 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC45O75419 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms