Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD4O60885 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD4O60885 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD4O60885 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD4O60885 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD4O60885 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD4O60885 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD4O60885 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD4O60885 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD4O60885 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD4O60885 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD4O60885 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD4O60885 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms