Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNC1O60486 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLXNC1O60486 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms