Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPLO60437 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPLO60437 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPLO60437 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPLO60437 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPLO60437 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPLO60437 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPLO60437 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPLO60437 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPLO60437 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPLO60437 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPLO60437 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPLO60437 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPLO60437 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPLO60437 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPLO60437 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPLO60437 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PPLO60437 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PPLO60437 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPLO60437 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPLO60437 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPLO60437 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPLO60437 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPLO60437 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPLO60437 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPLO60437 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms