Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIAA0556O60303 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms