Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX16O60231 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX16O60231 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms