Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF13O43567 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF13O43567 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF13O43567 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF13O43567 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF13O43567 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms