Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms