Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
E9PCH4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
E9PCH4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
E9PCH4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
E9PCH4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
E9PCH4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
E9PCH4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
E9PCH4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
E9PCH4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
E9PCH4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E9PCH4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
E9PCH4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
E9PCH4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
E9PCH4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
E9PCH4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
E9PCH4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
E9PCH4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
E9PCH4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
E9PCH4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
E9PCH4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
E9PCH4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms