Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E9PBE3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E9PBE3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E9PBE3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E9PBE3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms