Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DXG7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DXG7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DXG7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DXG7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DXG7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DXG7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms