Protein–RNA interactions for Protein: A8TX70

COL6A5, Collagen alpha-5(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 2,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A5A8TX70 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A5A8TX70 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL6A5A8TX70 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms