Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RGPD3A6NKT7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD3A6NKT7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms