Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms