Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP17L4A6NCW7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms