Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms