Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQF3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQF3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms