Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A0A087WSZ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms