Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNA1C-202ENST00000335762 6968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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